NVO vaikams konfederacija yra pasirašiusi 22 bendradarbiavimo sutartis su savivaldybėmis 9 apskrityse (Alytaus, Kauno, Klaipėdos, Marijampolės, Panevėžio, Šiaulių, Utenos, Vilniaus, Tauragės).
NVO vaikams konfederacija taip pat mezga ryšius su tokiais tarptautiniais tinklais kaip European Social Network ir Child Rights Connect.
Siekdama stiprinti bendradarbiavimą, socialinę partnerystę ir bendras iniciatyvas, NVO vaikams konfederacija yra pasirašiusi bendradarbiavimo sutartis su Lietuvos vaikų dienos centrų asociacija, Lietuvos vietos bendruomenių organizacijų sąjunga, Asociacija Rotary klubu „Vytis“ ir Lietuvos pensininkų sąjunga „Bočiai“.