NVO vaikams konfederacija yra pasirašiusi 22 bendradarbiavimo sutartis su savivaldybėmis 9 apskrityse (Alytaus, Kauno, Klaipėdos, Marijampolės, Panevėžio, Šiaulių, Utenos, Vilniaus, Tauragės).
NVO vaikams konfederacija taip pat mezga ryšius su tokiais tarptautiniais tinklais kaip European Social Network ir Child Rights Connect.
2023 m. kovo mėn. 24 d. tarp NVO vaikams konfederacijos ir Lietuvos vietos bendruomenių organizacijų sąjungos buvo pasirašyta bendradarbiavimo sutartis.